特成额的情况汇报其实非常简单平实：“盘获西洋四人，起出书信一封，系广东罗马当家所发，往陕传教，令蔡伯多禄送至湖南湘潭暂住，另着人送樊城，直走西安，札托李姓送往。”特成额所说的罗马当家就是指哆罗夷馆。没想到乾隆皇帝看到这份再也平常不过的奏章后勃然大怒，政府早已颁布禁教令，哆罗并未禀知督抚，辄遣人私至内地，送信传教，是严重的违法行为，必须严肃处理。
刚刚上任广东巡抚的孙士毅压根儿就不知道特成额的情况汇报，更对4名意大利传教士毫不知情。乾隆皇帝却不管孙士毅怎么想，下令孙士毅一定严查。早在当年4月15日，也就是意大利传教士偷渡到广州的时候，伊斯兰教哲赫林耶派创始人马明心的弟子田五，深恨清政府杀害马明心，领导回民在甘肃固原州盐茶厅起义，攻破西安州营土堡。南巡途中的乾隆皇帝，不得不在一个星期后返回京城，迅速调集大军镇压回民起义。乾隆皇帝接到特成额的汇报，马上就联系到了田五领导的回民起义，甚至潜意识里怀疑意大利传教士就是去甘肃联络起义的回民。
乾隆皇帝对孙士毅不满到了极点。因为外国人进入大清帝国只有粤海关一个口岸，西洋人跟中国人相貌差别很大，哆罗居然能够秘密派4名意大利人如过无人之境到内地传教。难道孙士毅就一点没有觉察？一路上途经千里，就没有关卡盘查？乾隆皇帝不由得担心起帝国军备之松弛，纪律之涣散，这样的军队连几个洋人都看不住，如何维护天朝上国的绝对安全？
孙士毅很快就得到了乾隆皇帝的旨意：西洋人与回人向属一教，恐其得有逆回滋事之信，故遣人赴陕，潜通消息，亦未可定。乾隆皇帝同时将旨意传遍全国，凡是接送过传教士、为传教士送信、留传教士住宿的中国教民一律逮捕究办。乾隆皇帝更想知道，哆罗派往陕西传教者，究竟要传与何人？他们传教的背后是否还有更大的阴谋？
大清帝国掀起了一场全民抓教徒的运动。在湖南、湖北、陕西、四川、广东、福建、江西、甘肃、山西、山东、直隶、安徽、贵州等省，凡是有信奉天主教的人，以及传授天主教的西洋人，统统抓起来送到北京受审。随着一份份情况汇报送到京城，乾隆皇帝震惊了。原来在帝国多个省份的角落，都有隐藏的西洋鬼子在传教，这远远超过自己当初的估计，现在看来绝不止4人，这些人可都是未经允许窜到内地的。愤怒的乾隆皇帝更加对广东官员失望，马上下令全国各地秘密严查。
全国行动起来了，一些怪异的教徒也浮出水面，乾隆皇帝的宠臣、陕甘总督福康安抓的嫌疑犯一下子增加到72人，这些天主教徒主要集中在甘肃、凉州二府，有些中国居民信奉了天主教后，甚至将父母所起的名字都给改了，其中有一位非常崇拜传教士多明我，也就是那位想方设法把澳门变成葡萄牙人的多明我，这位中国教民改名刘多明我。汉奸当到这份儿上也算铁杆儿了，连祖宗都能够背弃，乾隆皇帝能不害怕吗？
孙士毅接到乾隆皇帝旨意后，早已胆战心惊，意大利人就是从自己管辖的地盘上出发的，可以说是帝国教案的风暴源头。孙士毅毫不手软，将哆罗以及接送过意大利人的相关中国传教士一干人马全部抓获。这一抓又让乾隆皇帝大吃一惊，在广东竟有上百人信奉天主教，可是特成额情况汇报中的关键人物蔡伯多禄却神秘失踪了。
蔡伯多禄本来是福建人，真名叫住蔡鸣阜，信奉天主教后就改名了，这位爷一直在广东当江湖郎中，也属于崇洋媚外的汉奸，4名意大利传教士偷渡到广州，就是这位改掉父母所赐姓名的铁杆儿汉奸运作的。孙士毅的巡查部队先抄了蔡伯多禄的家，他只有逃到另外一位信徒家里。1784年9月26日晚上，孙士毅带着军队抄了蔡伯多禄躲藏的教徒家。这位汉奸跳窗逃走，连夜乘船逃到了澳门。
孙士毅的噩运来了。
乾隆皇帝怒气冲天，一定要将蔡伯多禄抓捕归案。孙士毅掌握了蔡伯多禄的情报后，便派了两名官员到澳门要人。当时澳门的葡萄牙人根本不知道蔡伯多禄已经逃到澳门，对孙士毅派来的人说蔡伯多禄不在澳门。孙士毅不信邪，很快就找到了运送蔡伯多禄逃亡澳门的船夫，船夫称看到蔡伯多禄进了澳门方济各修道院。10月3日，孙士毅再派人到澳门索人，可是蔡伯多禄已经乔装打扮，藏到了奥古斯丁修道院。
孙士毅很快意识到，从正常的渠道要想抓住蔡伯多禄基本不可能，葡萄牙人一定会想方设法阻挠。要想让葡萄牙人乖乖就范，那就要断了葡萄牙人的生路。孙士毅非常清楚，澳门的食物都是依靠广州供应，只要封锁澳门，葡萄牙人就会乖乖地交出蔡伯多禄以及其他的天主教徒。孙士毅立即又派官员到澳门，非常强硬地警告葡萄牙人，如果不交出蔡伯多禄一干人马，广东就封锁澳门。
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